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Ritsuko Akagi annonce à Misato Katsuragi que l'Institut Marduk à trouvé un quatrième enfant apte au pilotage des Evangelions. Il s'agit d'un ami de Shinji Ikari : Toji Suzuhara. Par ailleurs, une nouvelle Evangelion est en route pour effectuer des test au Japon, l'Evangelion Unité-03. Ritsuko prévoit de faire effectuer ces tests par Toji. Celui-ci est secrètement mis au courant de son nouveau rôle et se voit engagé dans les rangs de la NERV. Cependant, soucieuse de ne pas heurter la sensibilité de Shinji (pour lequel le pilotage des Evangelions reste une épreuve difficile), Misato garde le silence sur l'identité du nouveau qualifié. A l'école, tout semble normal. Mais Toji multiplie les absences et se montre de plus en plus inquiet.
